In big cancer databases, blood changes are being filed as tumor mutationsدر بانک‌های اطلاعاتی بزرگ سرطان، تغییرات خونی به اشتباه به‌عنوان mutation های تومور ثبت می‌شوند

More than half of patients listed as carrying a change in the gene DNMT3A had no such change in their tumor. The team sorted 1.28 million gene readings from 483 public studies to show where the changes really came from.بیش از نیمی از بیمارانی که گفته می‌شد تغییری در ژن DNMT3A دارند، اصلاً چنین تغییری در تومورشان وجود نداشت. این تیم 1.28 میلیون قرائت ژنی از 483 مطالعه عمومی را غربالگری کرد تا نشان دهد این تغییرات واقعاً از کجا سرچشمه می‌گیرند.

ترجمهٔ ماشینی است؛ برای دقت به متن اصلی انگلیسی مراجعه کنید.

Why it matters

Researchers around the world combine these free public databases to ask which genes are involved in which cancers. If a change found in blood gets recorded as a change in a tumor, some of those answers will be wrong. Here the mistake also shifted estimates of how long patients lived, which is the kind of number doctors and researchers rely on. Encouragingly, the authors say two lines of filtering, added before the databases are joined, remove the problem.پژوهشگران در سراسر جهان از این بانک‌های اطلاعاتی عمومی و رایگان استفاده می‌کنند تا دریابند کدام ژن‌ها در کدام سرطان‌ها نقش دارند. اگر تغییری که در خون پیدا شده به‌عنوان تغییری در تومور ثبت شود، برخی از این پاسخ‌ها نادرست خواهند بود. در این مورد، این اشتباه حتی برآوردهای مربوط به مدت زمان زنده ماندن بیماران را هم تحت تأثیر قرار داده؛ عددی که پزشکان و پژوهشگران به آن تکیه می‌کنند. نکته امیدوارکننده این است که نویسندگان می‌گویند دو مرحله فیلترگذاری که پیش از ترکیب بانک‌های اطلاعاتی اضافه می‌شوند، این مشکل را برطرف می‌کنند.

Who's behind it: M. Pan and colleagues, Unknown.

Summary by the Lemma AI · how we grade

Read the original paper (www.medrxiv.org) DOI